Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH17Q12864 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH17Q12864 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH17Q12864 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH17Q12864 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms