Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CGNL1Q0VF96 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CGNL1Q0VF96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CGNL1Q0VF96 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CGNL1Q0VF96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms