Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCRN3Q0VDG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCRN3Q0VDG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCRN3Q0VDG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms