Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMAGPQ0VAQ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAGPQ0VAQ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms