Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM27E3Q08E93 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM27E3Q08E93 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM27E3Q08E93 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM27E3Q08E93 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms