Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PUDPQ08623 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUDPQ08623 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUDPQ08623 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.4 ms