Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LOXL1Q08397 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LOXL1Q08397 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms