Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC3A1Q07837 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC3A1Q07837 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC3A1Q07837 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms