Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
COL16A1Q07092 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
COL16A1Q07092 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
COL16A1Q07092 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
COL16A1Q07092 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms