Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKAP4Q07065 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKAP4Q07065 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKAP4Q07065 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms