Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RELAQ04206 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RELAQ04206 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RELAQ04206 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RELAQ04206 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RELAQ04206 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RELAQ04206 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RELAQ04206 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RELAQ04206 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RELAQ04206 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RELAQ04206 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RELAQ04206 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RELAQ04206 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RELAQ04206 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RELAQ04206 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RELAQ04206 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RELAQ04206 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RELAQ04206 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RELAQ04206 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RELAQ04206 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RELAQ04206 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RELAQ04206 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RELAQ04206 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RELAQ04206 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RELAQ04206 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RELAQ04206 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RELAQ04206 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RELAQ04206 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELAQ04206 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELAQ04206 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELAQ04206 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RELAQ04206 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELAQ04206 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELAQ04206 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELAQ04206 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELAQ04206 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RELAQ04206 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELAQ04206 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELAQ04206 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELAQ04206 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELAQ04206 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELAQ04206 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RELAQ04206 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELAQ04206 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELAQ04206 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELAQ04206 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RELAQ04206 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RELAQ04206 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms