Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TGFBR3Q03167 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TGFBR3Q03167 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TGFBR3Q03167 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TGFBR3Q03167 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms