Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFITM3Q01628 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms