Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK16Q00536 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK16Q00536 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms