Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD1P98174 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD1P98174 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD1P98174 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD1P98174 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FGD1P98174 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FGD1P98174 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FGD1P98174 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FGD1P98174 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD1P98174 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD1P98174 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD1P98174 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD1P98174 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FGD1P98174 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD1P98174 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD1P98174 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD1P98174 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FGD1P98174 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FGD1P98174 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD1P98174 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD1P98174 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FGD1P98174 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FGD1P98174 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD1P98174 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD1P98174 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD1P98174 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD1P98174 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD1P98174 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FGD1P98174 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGD1P98174 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FGD1P98174 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FGD1P98174 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FGD1P98174 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD1P98174 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD1P98174 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD1P98174 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD1P98174 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD1P98174 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD1P98174 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD1P98174 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD1P98174 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD1P98174 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FGD1P98174 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FGD1P98174 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD1P98174 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD1P98174 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD1P98174 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FGD1P98174 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD1P98174 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD1P98174 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD1P98174 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD1P98174 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD1P98174 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD1P98174 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD1P98174 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD1P98174 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD1P98174 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD1P98174 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD1P98174 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD1P98174 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD1P98174 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD1P98174 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD1P98174 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms