Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF1P84077 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF1P84077 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF1P84077 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF1P84077 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF1P84077 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF1P84077 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF1P84077 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF1P84077 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF1P84077 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF1P84077 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF1P84077 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF1P84077 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF1P84077 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF1P84077 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF1P84077 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF1P84077 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF1P84077 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF1P84077 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF1P84077 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF1P84077 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF1P84077 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF1P84077 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF1P84077 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF1P84077 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF1P84077 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF1P84077 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF1P84077 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF1P84077 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF1P84077 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF1P84077 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF1P84077 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF1P84077 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF1P84077 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF1P84077 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARF1P84077 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARF1P84077 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARF1P84077 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms