Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NTHL1P78549 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTHL1P78549 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms