Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAE1P78406 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAE1P78406 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAE1P78406 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAE1P78406 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAE1P78406 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAE1P78406 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAE1P78406 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAE1P78406 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAE1P78406 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAE1P78406 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAE1P78406 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAE1P78406 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAE1P78406 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAE1P78406 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAE1P78406 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAE1P78406 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAE1P78406 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAE1P78406 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAE1P78406 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAE1P78406 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAE1P78406 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAE1P78406 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAE1P78406 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAE1P78406 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAE1P78406 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAE1P78406 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAE1P78406 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAE1P78406 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAE1P78406 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAE1P78406 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAE1P78406 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAE1P78406 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAE1P78406 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAE1P78406 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAE1P78406 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAE1P78406 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAE1P78406 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAE1P78406 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAE1P78406 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAE1P78406 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAE1P78406 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAE1P78406 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAE1P78406 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAE1P78406 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAE1P78406 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAE1P78406 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAE1P78406 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAE1P78406 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAE1P78406 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAE1P78406 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAE1P78406 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAE1P78406 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAE1P78406 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAE1P78406 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAE1P78406 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAE1P78406 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAE1P78406 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAE1P78406 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAE1P78406 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAE1P78406 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAE1P78406 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAE1P78406 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAE1P78406 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAE1P78406 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAE1P78406 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAE1P78406 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAE1P78406 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms