Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN10P78369 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN10P78369 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLDN10P78369 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLDN10P78369 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CLDN10P78369 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLDN10P78369 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN10P78369 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN10P78369 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN10P78369 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms