Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ASIC1P78348 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ASIC1P78348 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC1P78348 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC1P78348 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms