Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4BP68371 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB4BP68371 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBB4BP68371 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms