Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2LP62875 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2LP62875 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2LP62875 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2LP62875 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms