Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P61574 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HERVK_113P61574 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms