Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTXN1P60606 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTXN1P60606 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTXN1P60606 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms