Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00315P59091 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00315P59091 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms