Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA9P57773 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA9P57773 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA9P57773 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJA9P57773 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJA9P57773 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA9P57773 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJA9P57773 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJA9P57773 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA9P57773 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA9P57773 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJA9P57773 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA9P57773 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA9P57773 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA9P57773 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA9P57773 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA9P57773 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJA9P57773 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA9P57773 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA9P57773 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA9P57773 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA9P57773 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA9P57773 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA9P57773 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA9P57773 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA9P57773 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA9P57773 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA9P57773 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA9P57773 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA9P57773 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA9P57773 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA9P57773 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA9P57773 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA9P57773 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA9P57773 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA9P57773 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA9P57773 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA9P57773 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA9P57773 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA9P57773 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA9P57773 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA9P57773 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA9P57773 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA9P57773 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA9P57773 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA9P57773 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA9P57773 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA9P57773 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA9P57773 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA9P57773 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA9P57773 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA9P57773 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA9P57773 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA9P57773 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA9P57773 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA9P57773 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA9P57773 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA9P57773 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA9P57773 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA9P57773 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA9P57773 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA9P57773 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA9P57773 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA9P57773 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA9P57773 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA9P57773 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA9P57773 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJA9P57773 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJA9P57773 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJA9P57773 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJA9P57773 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJA9P57773 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJA9P57773 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJA9P57773 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJA9P57773 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJA9P57773 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJA9P57773 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJA9P57773 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJA9P57773 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms