Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GSDMDP57764 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GSDMDP57764 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms