Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX8P57073 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX8P57073 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX8P57073 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX8P57073 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX8P57073 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX8P57073 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX8P57073 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX8P57073 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX8P57073 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX8P57073 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX8P57073 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX8P57073 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX8P57073 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX8P57073 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX8P57073 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX8P57073 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX8P57073 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX8P57073 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX8P57073 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX8P57073 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX8P57073 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX8P57073 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX8P57073 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX8P57073 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX8P57073 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX8P57073 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX8P57073 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX8P57073 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX8P57073 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX8P57073 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX8P57073 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX8P57073 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX8P57073 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX8P57073 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOX8P57073 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX8P57073 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX8P57073 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOX8P57073 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOX8P57073 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX8P57073 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX8P57073 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX8P57073 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOX8P57073 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX8P57073 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX8P57073 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms