Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSCP56915 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSCP56915 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSCP56915 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GSCP56915 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSCP56915 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GSCP56915 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GSCP56915 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSCP56915 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSCP56915 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSCP56915 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSCP56915 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSCP56915 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GSCP56915 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSCP56915 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSCP56915 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GSCP56915 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GSCP56915 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSCP56915 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSCP56915 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GSCP56915 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSCP56915 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSCP56915 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GSCP56915 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSCP56915 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSCP56915 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSCP56915 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSCP56915 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSCP56915 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSCP56915 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSCP56915 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GSCP56915 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSCP56915 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSCP56915 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSCP56915 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSCP56915 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSCP56915 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSCP56915 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GSCP56915 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSCP56915 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSCP56915 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSCP56915 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSCP56915 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSCP56915 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSCP56915 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSCP56915 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSCP56915 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSCP56915 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSCP56915 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSCP56915 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSCP56915 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms