Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTTPP55157 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTTPP55157 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTTPP55157 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTTPP55157 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTTPP55157 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTTPP55157 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTTPP55157 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTTPP55157 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTTPP55157 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTTPP55157 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTTPP55157 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTTPP55157 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTTPP55157 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTTPP55157 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTTPP55157 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTTPP55157 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTTPP55157 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTTPP55157 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTTPP55157 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTTPP55157 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTTPP55157 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTTPP55157 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTTPP55157 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MTTPP55157 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTTPP55157 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTTPP55157 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTTPP55157 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTTPP55157 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTTPP55157 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTTPP55157 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTTPP55157 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms