Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAD23BP54727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAD23BP54727 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD23BP54727 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms