Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP12AP54707 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP12AP54707 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP12AP54707 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms