Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKAG1P54619 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKAG1P54619 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKAG1P54619 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms