Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BLMP54132 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BLMP54132 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BLMP54132 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BLMP54132 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BLMP54132 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BLMP54132 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BLMP54132 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BLMP54132 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BLMP54132 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BLMP54132 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BLMP54132 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BLMP54132 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BLMP54132 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BLMP54132 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BLMP54132 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BLMP54132 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BLMP54132 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BLMP54132 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BLMP54132 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BLMP54132 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BLMP54132 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BLMP54132 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BLMP54132 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BLMP54132 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BLMP54132 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BLMP54132 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BLMP54132 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BLMP54132 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BLMP54132 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BLMP54132 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BLMP54132 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BLMP54132 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BLMP54132 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BLMP54132 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BLMP54132 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BLMP54132 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BLMP54132 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BLMP54132 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BLMP54132 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
BLMP54132 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BLMP54132 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BLMP54132 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BLMP54132 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
BLMP54132 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
BLMP54132 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BLMP54132 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
BLMP54132 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BLMP54132 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BLMP54132 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
BLMP54132 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
BLMP54132 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BLMP54132 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
BLMP54132 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
BLMP54132 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
BLMP54132 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BLMP54132 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BLMP54132 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
BLMP54132 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BLMP54132 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
BLMP54132 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BLMP54132 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BLMP54132 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
BLMP54132 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BLMP54132 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BLMP54132 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BLMP54132 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
BLMP54132 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
BLMP54132 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BLMP54132 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
BLMP54132 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BLMP54132 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms