Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGA8P53708 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGA8P53708 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGA8P53708 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGA8P53708 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms