Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP5CP53041 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP5CP53041 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP5CP53041 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP5CP53041 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP5CP53041 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP5CP53041 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP5CP53041 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP5CP53041 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPP5CP53041 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms