Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP98P52948 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP98P52948 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP98P52948 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP98P52948 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP98P52948 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP98P52948 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP98P52948 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP98P52948 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP98P52948 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP98P52948 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP98P52948 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP98P52948 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP98P52948 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP98P52948 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP98P52948 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP98P52948 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUP98P52948 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUP98P52948 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP98P52948 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP98P52948 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP98P52948 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP98P52948 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP98P52948 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUP98P52948 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NUP98P52948 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NUP98P52948 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP98P52948 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP98P52948 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP98P52948 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP98P52948 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NUP98P52948 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP98P52948 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NUP98P52948 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NUP98P52948 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP98P52948 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP98P52948 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP98P52948 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NUP98P52948 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NUP98P52948 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUP98P52948 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NUP98P52948 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NUP98P52948 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP98P52948 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP98P52948 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP98P52948 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP98P52948 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP98P52948 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NUP98P52948 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP98P52948 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP98P52948 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NUP98P52948 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NUP98P52948 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP98P52948 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP98P52948 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NUP98P52948 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NUP98P52948 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP98P52948 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP98P52948 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP98P52948 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NUP98P52948 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP98P52948 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP98P52948 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP98P52948 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NUP98P52948 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NUP98P52948 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NUP98P52948 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms