Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMSP52788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMSP52788 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMSP52788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMSP52788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMSP52788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMSP52788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMSP52788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMSP52788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMSP52788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMSP52788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMSP52788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMSP52788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMSP52788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMSP52788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMSP52788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMSP52788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMSP52788 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMSP52788 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMSP52788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMSP52788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMSP52788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMSP52788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMSP52788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMSP52788 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMSP52788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMSP52788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMSP52788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMSP52788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMSP52788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMSP52788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMSP52788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMSP52788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMSP52788 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMSP52788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMSP52788 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMSP52788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMSP52788 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMSP52788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMSP52788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms