Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEK3P51956 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK3P51956 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEK3P51956 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEK3P51956 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK3P51956 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK3P51956 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEK3P51956 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK3P51956 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK3P51956 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEK3P51956 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK3P51956 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK3P51956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK3P51956 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEK3P51956 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEK3P51956 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEK3P51956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEK3P51956 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEK3P51956 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEK3P51956 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEK3P51956 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEK3P51956 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK3P51956 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK3P51956 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEK3P51956 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEK3P51956 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK3P51956 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK3P51956 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms