Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDE6CP51160 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE6CP51160 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6CP51160 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms