Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB27AP51159 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAB27AP51159 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB27AP51159 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB27AP51159 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms