Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HARS2P49590 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HARS2P49590 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARS2P49590 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARS2P49590 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARS2P49590 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARS2P49590 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARS2P49590 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HARS2P49590 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARS2P49590 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARS2P49590 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARS2P49590 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HARS2P49590 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HARS2P49590 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARS2P49590 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARS2P49590 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARS2P49590 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARS2P49590 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARS2P49590 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARS2P49590 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARS2P49590 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARS2P49590 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARS2P49590 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARS2P49590 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARS2P49590 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARS2P49590 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARS2P49590 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARS2P49590 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARS2P49590 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARS2P49590 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARS2P49590 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARS2P49590 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARS2P49590 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARS2P49590 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARS2P49590 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARS2P49590 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARS2P49590 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARS2P49590 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARS2P49590 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HARS2P49590 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HARS2P49590 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms