Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC11A1P49279 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC11A1P49279 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC11A1P49279 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms