Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMAN1P49257 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMAN1P49257 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMAN1P49257 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMAN1P49257 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms