Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TNNI2P48788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNNI2P48788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNNI2P48788 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNI2P48788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms