Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1A1P48729 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1A1P48729 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms