Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT5P48643 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT5P48643 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT5P48643 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT5P48643 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCT5P48643 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCT5P48643 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT5P48643 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT5P48643 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT5P48643 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT5P48643 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT5P48643 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCT5P48643 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT5P48643 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT5P48643 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCT5P48643 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCT5P48643 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCT5P48643 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT5P48643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT5P48643 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT5P48643 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCT5P48643 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT5P48643 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT5P48643 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT5P48643 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT5P48643 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT5P48643 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCT5P48643 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCT5P48643 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT5P48643 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT5P48643 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT5P48643 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT5P48643 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT5P48643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCT5P48643 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT5P48643 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT5P48643 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT5P48643 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT5P48643 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCT5P48643 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT5P48643 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT5P48643 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT5P48643 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT5P48643 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCT5P48643 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCT5P48643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCT5P48643 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms