Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PIP4K2AP48426 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PIP4K2AP48426 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PIP4K2AP48426 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PIP4K2AP48426 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PIP4K2AP48426 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PIP4K2AP48426 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PIP4K2AP48426 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms