Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGRP47804 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGRP47804 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGRP47804 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RGRP47804 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGRP47804 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGRP47804 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGRP47804 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RGRP47804 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGRP47804 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGRP47804 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGRP47804 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGRP47804 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGRP47804 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGRP47804 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGRP47804 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGRP47804 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGRP47804 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGRP47804 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGRP47804 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGRP47804 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGRP47804 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGRP47804 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGRP47804 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGRP47804 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RGRP47804 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RGRP47804 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGRP47804 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RGRP47804 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGRP47804 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RGRP47804 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGRP47804 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGRP47804 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGRP47804 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGRP47804 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGRP47804 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGRP47804 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGRP47804 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGRP47804 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGRP47804 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGRP47804 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGRP47804 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGRP47804 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGRP47804 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGRP47804 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGRP47804 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGRP47804 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGRP47804 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms