Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSN1S1P47710 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSN1S1P47710 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms